原位雜交技術（in situhybridization）是以標記的核酸分子為探針，在組織細胞原位檢測特異核酸分子的技術。使含有特異序列、經過標記的核酸單鏈即探針，在適宜條件下與組織細胞中的互補核酸單鏈即靶核酸發生雜交，再以自顯影或細胞化學方法對標記探針進行探測，從而在細胞原位顯示特異的DNA或RNA分子。
可以檢測cRNA、miRNA、LnRNA、DNA。可以各種種屬的標本，包括哺乳動物、爬行動物、菌、植物標本。也可以檢測組織芯片。
同一樣本可以多次做原位雜交實驗嗎?
一般情況下，如果操作沒有得到理想的結果，是可以將探針洗滌然后進行再次的雜交的。如果使用的是直標型探針，還可以使用不同探針對同一樣本進行反復雜交。針對不同的樣本，處理方法略有不同。
原位雜交實操中哪些因素比較重要?
重要的因素：溫度、光照、濕度和試劑的PH值。溫度和濕度直接影響著探針和目標DNA的雜交效率；光照影響著熒光染料的強度，所以探針要避光保存，其已經雜交的片子可用防熒光淬火劑封片且避光保存；各種試劑pH也要達到要求，這也直接關系到原位雜交的穩定性。
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